Геном бактерии E.Coli реконструирован с использованием желчного камня из 600-летней мумии

E.coli — это тип бактерий, который представляет собой серьезную проблему для здоровья и приводит к многочисленным смертельным случаям. Хотя бактерия обнаруживается в кишечнике здоровых людей и животных, история ее эволюции остается неизвестной. Теперь исследователи из Университета Макмастера успешно реконструировали первый древний геном кишечной палочки, используя желчный камень итальянской мумии 16-го века. E.coli не приводит к пандемиям и скорее относится к комменсалам. Такие виды бактерий прячутся внутри наших тел и выжидают, чтобы атаковать хозяина, когда он становится уязвимым. Обычно они атакуют в таких условиях, как стресс, иммунодефицит или болезнь.

Такие пандемии, как Черная смерть, унесшая около 200 миллионов жизней по всему миру, хорошо задокументированы. Но нет доступных исторических данных о количестве жизней, потерянных из-за E.coli, даже несмотря на то, что бактерия также значительно повлияла на здоровье человека.

«Строгое внимание к патогенам, вызывающим пандемии, как единственному повествованию о массовой смертности в нашем прошлом упускает из виду большое бремя, которое возникает из-за условно-патогенных комменсалов, вызванных стрессом прожитых жизней», — сказал генетик-эволюционист Хендрик Пойнар, директор Центра древней ДНК Макмастера и главный исследователь Университетского института исследований инфекционных заболеваний Майкла Дж. ДеГрута.

В исследовании, опубликованном в журнале Communication Biology, исследователи стремились создать 400-летнего предка E.coli, который дал бы им представление о его эволюции. Они использовали фрагменты мумифицированных тел группы итальянских дворян, которые были обнаружены в аббатстве Святого Доменико Маджоре в Неаполе в 1983 году.

Команда проанализировала мумию одного из дворян, который, как считается, умер в 1586 году в возрасте 48 лет. Исследователи также отметили, что у этого человека были камни в желчном пузыре и из-за этого он страдал хроническим воспалением желчного пузыря.

«Когда мы исследовали эти останки, не было никаких доказательств того, что у этого человека была кишечная палочка. В отличие от такой инфекции, как оспа, физиологических показателей нет. Никто не знал, что это такое», — сказал Джордж Лонг, аспирант биоинформатики в McMaster. Лонг также является ведущим автором исследования и провел анализ мумии.

Исследователи выделили фрагменты бактерии из организма и использовали материал для разработки генома. Благодаря этому они смогли понять функции генома и теперь надеются помочь другим исследователям, которые ищут такие скрытые патогены.

Большинство форм E.coli не представляют опасности для хозяина, пока живут в его кишечнике. Но было обнаружено, что некоторые штаммы вызывают даже вспышки пищевого отравления со смертельным исходом и инфекции кровотока. Кроме того, E.coli легко адаптируется, что делает ее устойчивой к лечению.